香莢蘭授粉是每年重要的工作，可說是影響產量的最大關鍵，因台灣還有未適合授粉的昆蟲，且自然授粉機率相當低，所以必須藉由人工授粉來提升產量。
香莢蘭為雌雄同株、同花，所以授粉的操作就是讓香莢蘭自花授粉，最佳授粉時間為早上的6:30分至11:30分，需準備的工具可以選擇方便取的【牙籤】
授粉前先將花朵唇瓣的構造撥下，直接破壞即可(不會影響授粉)，露出合蕊柱的部分。
合蕊柱的特寫，但蘭科植物特有的一片蕊喙(如上圖)，會將雄蕊與雌蕊的隔開，避免自花授粉。
將牙籤把蕊喙翻起，蕊喙的下方穴狀處即是柱頭，將牙籤抵住蕊喙，再用拇指將頂部的雄蕊輕輕壓向柱頭的位置，輕壓約0.5~1秒，授粉及算完成。
雄蕊具有黏性的花粉塊。